Merle on geoinformaatika teadur, kelle põhihuvi on maastiku modelleerimine. Tema doktoritöö ja järeldoktorantuur käsitlesid paleogeograafiat, rannikumaastikku ja merepinna muutusi. Ta keskendub maastiku modelleerimisele, digitaalsetele kõrgusandmetele, raster- ja punktipilveanalüüsidele.